與傳統方案相比,該平臺具有更便攜、檢測過(guò)程更快、更智能的優(yōu)勢,適合于在大范圍內同時(shí)開(kāi)展疫情的檢測工作,將極大提升疑似病例的確診效率,助力疫情防控。
便攜
單人可攜帶,隨時(shí)隨地進(jìn)行基因采樣、測序
新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染的肺炎疫情暴發(fā)以來(lái),傳統試劑盒(熒光定量PCR核酸檢測試劑盒)在患者臨床診斷和疑似患者排查中發(fā)揮了重要作用, 但是該方法對檢測環(huán)境有嚴格要求:
- 需要對樣本集中送檢,實(shí)驗室檢測能力有限
- 無(wú)法滿(mǎn)足當前快速增長(cháng)的疑似患者的排查、診斷需求
基于希望組的納米孔測序方案:
使用小型化測序設備,單人即可攜帶,克服了場(chǎng)地限制,可以在各臨時(shí)醫療工作站、患者現場(chǎng)進(jìn)行基因采樣和測序,為患者確診提供快速檢測手段,縮短患者等待時(shí)間、緩解檢測壓力,有效抑制疫情的進(jìn)一步擴散。(延伸閱讀:希望組宣布完成基于納米孔測技術(shù)的冠狀病毒測序試劑盒的研發(fā))
實(shí)時(shí)
5G網(wǎng)絡(luò )實(shí)時(shí)上傳數據,快速完成病毒分析
在沒(méi)有固定IT基礎設施的臨時(shí)醫療站,或缺少有線(xiàn)網(wǎng)絡(luò )和本地計算資源的工作點(diǎn),只能人工將采集的資源送遞到集中站點(diǎn)處理,時(shí)效性差。
希望組與華為5G、華為云團隊一起完成了實(shí)時(shí)機動(dòng)的測序數據上傳,并依托華為云基因容器的高性能:
- 自動(dòng)化測序分析引擎和海量的計算資源
- 病毒數據的遠程上傳、分析,實(shí)現數據的實(shí)時(shí)采集、實(shí)時(shí)分析、實(shí)時(shí)上報
該方案能夠無(wú)縫擴展到其他病原的檢測和監測,符合傳染性病原疫情的早發(fā)現,早隔離,迅速切斷傳播路徑的防控理念。
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智能
檢測病毒基因組變異,精準定位突變位點(diǎn)
此外,對病毒基因組學(xué)和流行病學(xué)進(jìn)行實(shí)時(shí)和快速研究也是疫情防控中最重要也是容易缺失的一環(huán)。
例如:
截止到2月13日,全國確診陽(yáng)性患者達到59,000多例,但是全球所有新冠狀病毒的基因組數據卻只有87個(gè),這對全球了解新冠狀病毒的產(chǎn)生,傳播(包括時(shí)間和空間溯源),演化以及病毒毒力和感染力的研究造成了巨大的困難。
而這些研究對于檢測方案的研發(fā),相應疫苗和藥物研發(fā)具有重大意義,并且能夠為疫情防控決策提供科學(xué)支持,其和診斷治療同樣重要甚至更為重要。
希望組基于ONT第三代測序技術(shù)結合華為云基因容器+AI容器的實(shí)時(shí)病毒基因組檢測平臺能夠在數小時(shí)之內同時(shí)完成樣本檢測以及病毒基因組變異檢測。
突破了包括實(shí)時(shí)熒光RT-PCR和傳統第二代測序技術(shù)在內的現有檢測技術(shù)的局限以及對場(chǎng)地、外界環(huán)境的限制、提升了流程檢測的便攜性和測序效率,并推進(jìn)病毒檢測和基因組變異監測工作全面下移,能夠更好地服務(wù)于新冠狀病毒的疫情防控,為廣大人民的健康保駕護航。